Lato 2016

Po tym, jak świat ledwie uniknął destrukcji w wyniku „Największego, Najbardziej Okropnego i Najtragiczniejszego Wydarzenia w Dziejach Ludzkości”, spowodowanego przez „Ostateczną Rozpacz”, powołano „Fundację Przyszłości”, która ma ochronić świat przed chaosem. Instytucja ta wprowadza w życie plany mające na celu przywrócenie normalnego porządku. Tymczasem Makoto Naegi jest podejrzewany o zdradę z powodu ochraniania tak zwanych „Pozostałości Rozpaczy”, które mogą doprowadzić do tragedii. Wobec tego członkowie Fundacji spotykają się, ponieważ muszą zadecydować o karze czekającej Naegiego, by ostatecznie raz jeszcze dać się uwięzić i wplątać w chore rozgrywki Monokumy, ogłaszającego rozpoczęcie „Ostatecznego Zabijania”. Jedyne, co pozostaje naszym bohaterom, aby uniknąć śmierci, to kolejna próba wytropienia zdrajcy i wykonanie na nim kary.

Akademia Szczytu Nadziei to specjalny projekt rządowy mający na celu zgromadzenie młodzieży o ponadprzeciętnych umiejętnościach. Jednakże siedemdziesiąta siódma klasa głównego kursu jest ponadprzeciętna nawet jak na swoje niesamowite zdolności, ponadto skupia uczniów, którzy dobrze zdają sobie sprawę z natury koleżeństwa i starają się dążyć do lepszego jutra podczas kolekcjonowania licealnych wspomnień. Szkoda tylko, iż żadne z nich nie ma pojęcia o tajemniczych rozgrywkach i dyskryminacji uczniów, które odbywają się tuż pod ich nosem… W tej placówce młodzież może uczestniczyć w dwóch różnych kursach nauczania: głównym – zbierającym geniuszy w swoich dziedzinach, oraz przygotowującym, do którego dostać może się każdy mający na koncie wystarczającą ilość gotówki. Przypadkowe spotkanie tych dwóch światów sprowadzi dalsze losy Akademii na zupełnie nowe tory.

Arata Kaizaki jest 27-letnim bezrobotnym mężczyzną. Bezskutecznie odbywa jedną rozmowę kwalifikacyjną za drugą, ale w znalezieniu pracy nie pomaga mu fakt, że swoją pierwszą firmę opuścił po zaledwie trzech miesiącach. Na domiar złego rodzice zamierzają przestać wspomagać go finansowo.
Pewnego dnia, wracając z zakrapianego alkoholem spotkania z licealnym znajomym, spotyka dziwnego mężczyznę, który wie o nim zdecydowanie za dużo. Nieznajomy wręcza mu wizytówkę i przedstawia się jako Ryou Yoake, pracownik Laboratorium ReLIFE, po czym składa mu podejrzaną, ale atrakcyjną propozycję. Arata ma zostać obiektem programu, którego celem jest pomoc ludziom w jego sytuacji i ułatwienie im powrotu na korporacyjną scenę. Podczas trwającego rok eksperymentu wszystkie koszty związane z jego potrzebami będą pokrywane przez ReLIFE, a po zakończeniu projektu otrzyma odpowiednie referencje i zostanie przedstawiony firmie, w której następnie rozpocznie pracę. Wszystko, co musi zrobić, to przez ten czas uczęszczać do liceum, a umożliwić mają mu to specjalne tabletki opracowane przez Laboratorium, które zmienią go z powrotem w 17-latka. Bohater początkowo nie zgadza się na zaproponowany układ, jednak następnego dnia budzi się, wyglądając zdecydowanie młodziej, i z przerażeniem odkrywa, że w nocy zażył ów dziwny specyfik, a Ryou już czeka pod jego drzwiami.