Zima 2006

Głównym bohaterem tej historii jest Shirou Emiya, uczeń szkoły Homurabara Gakuen w mieście Fuyukishi. 10 lat temu Shirou o mało nie zginął, gdyż znalazł się pomiędzy dwojgiem wojowników, którzy w walce zniszczyli ogromną część miasta. Wtedy właśnie stracili życie jego rodzice. Kiritsugu Emiya, jeden z wspomnianych wojowników, znajduje Shirou i przyjmuje go do własnego domu, zaczyna traktować go nawet jak własnego syna. Kiritsugu opowiada przybranemu dziecku o swoim największym marzeniu: zostaniu „bohaterem sprawiedliwości” – obrońcą ludzkości. Shirou jeszcze o tym nie wie, że w przyszłości podąży jego śladem.
Długo po śmierci Kiritsugu wybucha piąta „Wojna o święty Graal”, toczona co kilka lat między wybranymi przez święty Graal siedmioma magami. Każdemu z magów święty Graal wzywa z zaświatów duszę wielkiego bohatera z przeszłości – Sługę (Servant), by walczył u boku swojego Mistrza. Magowie i ich Słudzy mają walczyć ze sobą, a ostatniemu z magów, który przetrwa, święty Graal spełni jego dowolne życzenie. Podczas każdej z Wojen walczyć może po jednym Słudze z siedmiu klas: Szermierz, Łucznik, Lansjer, Berserker, Jeździec, Zabójca i Czarownik.

Fumihiko Matsumaru pracownik działu reklamy w firmie produkującej chipsy umawia się na randkę z koleżanką z pracy. Zostaje jednak wystawiony do wiatru. Przed wyrzuceniem biletów do kina powstrzymuje go młoda dziewczyna o imieniu Aka. Po seansie okazuje się, iż mieszkają blisko siebie. Tej samej nocy bohaterka traci wszystko w pożarze domu. Fumihiko postanawia zaprosić ją do siebie, po czym jeszcze tej samej nocy lądują ze sobą w łóżku. W ten oto nietypowy dla anime sposób zaczyna się romans naszych bohaterów.