W mieście Fuyuki odbywa się długowieczny rytuał polegający na bitwach między siedmioma magami a ich sługami. Rytuał ten znany jest jako Wojna Świętego Graala i obiecuje spełnić każde życzenie zwycięzcy. Ponieważ wojna wkracza w piątą iterację, scena jest przygotowana dla Rin Toosaki, która zastąpi dziedzictwo swojego ojca.
Rin pragnie przywołać Saber, o którym mówi się, że jest najpotężniejszą klasą. Ale kiedy przeliczy się i zamiast tego wezwie Archera, jak sobie poradzi w bitwach, które ją czekają?
