Vampire Knight Guilty

Ciąg dalszy wydarzeń z poprzedniego sezonu.
Yuuki będąc małą dziewczynką zostaje uratowana przed wygłodniałym wampirem, co dziwne, przez przedstawiciela tej samej krwiopijczej rasy. Powierzona pod opiekę dyrektorowi Akademii Cross, zaczyna uczęszczać do Dziennej Klasy. Szkoła ma nietypowy charakter, ponieważ odbywają się tu również zajęcia Klasy Nocnej, której uczniami są wampiry. Żeby żyć w symbiozie z ludźmi, zamiast tradycyjnego posiłku w postaci krwi, zażywają tabletki, które ją imitują. Wszystko zostaje utrzymane w sekrecie, tylko dzięki staraniom dwóch prefektów – Kiryuu Zero, któremu kilka lat wcześniej wampir wymordował rodzinę, oraz Cross Yuuki. Główna bohaterka zadurza się w wampirze Kaname, swoim wybawicielu z dzieciństwa. Oprócz tego epizodu, dziewczyna nie pamięta jednak nic ze swojej przeszłości. Postanawia więc zapytać wampira o wydarzenia poprzedzające dzień, w którym została przez niego uratowana, sądząc, że może być w jakiś sposób powiązany z jej przeszłością.